ثبت أن اختبارات الذكاء التقليدية مثل وكسلر وستانفورد بينية غير فعالة في تقييم أطفال التوحد ، لذلك فان المركز يستخدم الاختبارات النمائية والتي أثبتت جدواها في تقييم القدرات الفعلية والكامنة لهؤلاء الأطفال.

وعلي قمة هذه الاختبارات يأتي البروفيل النفسي تعليمي المعدل PEP-R والذي يرسم صورة بيانية دقيقة عن القدرات الفعلية والكامنة بمقياسيه النمائي والسلوكي، وهو أداة فريدة في نوعها كونه يستخدم في تشخيص وتقييم الحالات ،أضافه إلي استخدامه في تصميم البرامج الفردية مراعيا نقاط القوة والضعف لدي الطفل علاوة على استخدامه في تقييم مدي نجاح البرنامج الفردي بعد تطبيقه والإعداد للبرنامج التالي في ضوء ما تم انجازه، والانتقال إلي مستوي وظيفي اعلى.

هذا بالإضافة إلي استخدام الدليل التشخيصي الإحصائي الرابع المعدلIV DSM الصادر عن رابطة الطب النفسي الأمريكية في عام 1994 والذي يرصد الخصائص والسمات المميزة لاضطراب طيف التوحد، ويضع المحكات التشخيصية لكل فئة من فئات الطيف.

وبالنسبة لفئة المراهقين فان مركز الإمارات للتوحد يعتبر هو أول مركز يستخدم البروفيل النفسي – تعليمي للمراهقين والبالغين AAPEP كأداة لتقييم القدرات المهنية والحياتية الهامة لوظيفة استقلالية بالمنزل والمجتمع.